Biochimie cellulaire et fonctionnelle Cours PDF
 |
| Biochimie cellulaire et fonctionnelle Cours PDF |
Cours 1:
Objectifs de l’enseignement:
Cette matière a pour objectif de donner les bases de la dynamique membranaire,la compartimentation intracellulaire et son intégration dans la fonction cellulaire ainsi que la transmission des signaux intracellulaires à partir de ligands hydrophiles. Notions de modules et d’interconnexions de réseaux de signaling. Initiation à la génomique biochimique.
Connaissances préalables recommandées.
L’étudiant devra avoir les bases en biochimie, Immunologie, microbiologie et génétique.
Contenu de la matière :
1. Compartimentation fonctionnelle de la cellule (vue d’ensemble):
2. Biomembranes:
a. Composition des membranes : isolement, composition.
b. Architecture biomoléculaire des membranes.
c. Les échanges membranaires : transport passif, transport actif, transport vésiculaire
d. Les protéines d’adhésion et de reconnaissance cellulaire (protéines récepteurs, translocons…)
e. Expression d’antigènes, marqueurs de virulence et de récepteurs cellulaires
f. Récepteurs, désensibilisation et régulation de la réponse cellulaire
3. Relation structure-fonction de la cellule:
a. Biosynthèse des lipides, des protéines membranaires et des protéines de sécrétion
b. Le cytosquelette : Réponse du cytosquelette aux stimuli biochimiques et mécaniques et son rôle dans l’adhésion focale (Les fibres de stress). Exemples de l’implication du cytosquelette dans diverses voies de signalisation cellulaire.
c. La fibre et la contraction musculaire : structure et fonction des micro filaments d’actine et de myosine.
d. La mitochondrie et la chaine de phosphorylation oxydative: structure, fonction, les sites de couplage, fractionnement du système oxydo-phosphorylant.
a. Ribosome : synthèse protéique, maturation et adressage des protéines.
b. Le Système ubiquitine /protéasome : structure et fonction.
c. Le Système lysosomal : structure et fonction.
d. Le noyau et échanges avec le cytosquelette.
4. La glycosylation des macromolécules et rôle biologique :
a. Les glycoprotéines : type de liaison de glycosylation (O- glycosylation et N-glycosylation) intérêt de la glycosylation (stabilité des protéines, reconnaissance…), étude moléculaire de quelques glycoprotéines (les glycoprotéines sériques, les glycoprotéines des groupes sanguins), les glycoprotéines humaines diverses (les lectines, glycoprotéines des membranes cellulaires, les GAG…)
b. Les glycolipides : les glycérolipides, les glycosphingolipides (structure et fonction)
5. Transduction du signale et régulation de la fonction cellulaire:
5.1. Récepteurs et ligands :- Examples : Adrénaline, insuline, PAF, facteurs de croissance, mitogènes.
5.2. Transducteurs et Facteurs de couplage : Cycle d’activation des protéines G trimériques G (ex : , q, o) et monomériques (RAS oncogéniques) ; Adaptateurs Grb2/Sos (domaines SH2, SH3), protéines scaffolds.
5.3. Amplification du signal via les seconds messagers:
5.3.1. Cascade phospholipases C et D/DAG/IP3/Ca2+ (ex cellule cardiaque)
5.3.2. Cascade phospholipase A2/ Eicosanoides
5.3.3. Cascade AMPc/PKA/CREB (ex : cellule hépatique, cellule musculaire)
5.3.4. Cascade NO/GMPc (ex neurone, cellule endothéliale)
5.4. Amplification du signal via les cascades de MAPkinases :
- Protéines kinases (A, B/Akt, C, CAM, MAP)
- Protéines phosphatases (2A, calcineurin), tyrosine phosphatases, PTEN (ex : cancer).
5.4.1. Récepteurs Tyrosine kinase (ex : signalisation de l’insuline)
5.4.2. PI3kinase, AKt/PKB (domaines PH, PIP3)
5.4.3. MAPKinases / Facteurs de transcription (ex : cancer)
6. Anomalies de signalisation et pathologies:
6.1. Anomalie dans l’expression protéique et pathologie (ex : EGF-R, p21ras et oncogenèse).
6.2.-Anomalies de tri protéiques et pathologies héréditaires (mitochondries, lysosomes, noyau).